饮水机尽量不要放在有太阳的地方，因为大部分饮水机是塑料的，经过阳光照射后，会发生化学反应，继续使用会影响人体健康。最好的储存方法就是，将饮水机放置在阴凉干燥通风处，避免阳光照射。
饮水机长时间放在阳光下，不仅会影响饮水机，还会导致水桶里面的水变质，因为纯净水都是有保质期的，不可放置在阳光底下，否则纯净水的保质期会缩短，如果饮用了变质的纯净水，可能会出现腹泻的现象。
平时放置饮水机时，不要与冰箱挨在一起，应该将饮水机放在客厅内，避免潮湿的地方。饮水机有一定的辐射，所以不能长时间待在饮水机旁边，以免影响身体健康。对于孕妇来说，更不能长期待在饮水机旁边，否则会影响胎儿的健康。
饮水机不可一直加热，反复加热的水会让活性物质降低，给肠胃造成危害，所以在不喝水的情况下，应该将饮水机的电源关闭。饮水机应该定期清洗，不然会滋生很多的病原微生物，出现肠道疾病的现象。