1、房屋类型不符要求：公积金贷款只能用于购买住宅性质的房屋，也就是土地使用年限为70年的房屋。因此如果二手房是单身公寓、loft公寓和写字楼、商铺、经济适用房、小产权房等商服用地的房屋，土地使用年限为40年，是不能用公积金贷款购买的，只能通过商业贷款购买。
2、房屋产权不明晰：办理公积金贷款需要将所购房屋作为抵押物，以确保贷款安全性。这意味着用来贷款的二手房产权要明晰，即已经下发了不动产权证，且没有处于抵押状态，反之如果二手房的不动产权证书还没有出来，或者是房屋处于抵押状态，都不能办理公积金贷款。
3、房屋房龄太老：公积金贷款对二手住房的房龄有一定限制，一般要求房龄不能超过15年，且房龄加贷款期限不超过30年。毕竟房龄太老的二手房市场流通价值不高，并且会影响贷款期限，是不能通过公积金贷款购买的，甚至有的都无法通过商业贷款购买。
4、房屋没有抵押价值：比如像二手房太破旧了，无法住人，并且地段不好，很难脱手等，一般是没有抵押的价值了，也不能通过公积金贷款购买。毕竟这类房屋即便抵押给了住房公积金中心，也会存在很大风险，要是借款人逾期后不还款，就算把房子拍卖也会卖不出去。
5、房贷次数超限：借款人如果已经过通过公积金贷款买了两套房子，不管房贷是否还清，都无法再使用公积金贷款买房，因为已经超过了公积金贷款使用次数，只能通过商业贷款来购买二手房了。
6、不符合公积金贷款条件：借款人缴纳公积金时间低于当地住房公积金中心规定的要求，或者是期间有发生过断缴，比如大多数地区要求是在贷款前连续缴满1年及以上公积金。或者是公积金账户没有充足的余额等，也是不能通过公积金贷款购买二手房的。
公积金贷款流程
1、携带本人有效身份证明、购房合同、房产证等资料到当地的住房公积金管理中心进行登记，领取公积金贷款申请表。
2、按照要求填写住房公积金贷款申请表，并提供办理住房公积金贷款所需的相关材料。
3、住房公积金管理中心受理借款申请人资料，审批确定贷款额度及年限。
4、房屋买卖双方需要到房产局及土地局办理“两证”交易过户手续。
5、携带办理交易过户的“两证”及契税完税发票到住房公积金管理中心，住房公积金管理中心会出具贷款承诺书，携带贷款承诺书到指定的银行签订贷款合同，抵押合同，然后办理抵押手续。
6、办理完相关手续后，住房公积金管理中心会委托银行发放贷款资金，获得贷款资金的借款人按时偿还欠款即可。